Шредер и его зловещий Клан Футов держат в страхе весь Нью-Йорк. Они контролируют всех – от полицейски до политиков. Город нуждается в героях…
Будущее выглядит мрачным, пока из канализации не поднимается и не раскрывает свое предназначение четверка отверженных братьев — Черепашек-ниндзя. Черепашки должны работать вместе с бесстрашным репортером Эйприл и ее саркастическим оператором Верном Фенвиком. Они постараются спасти город и разгадать дьявольский план Шреддера.